Kapitan jachtowy. Przepłynęła ponad 250 tys. mil morskich, samotnie opłynęła świat – często w rejsach i regatach samotnych lub dwuosobowych. Zdobywczyni 4 miejsca w klasie (na 24 startujące jachty) w samotnych regatach transatlantyckich OSTAR 2000 z Plymouth o Newport. Był to pierwszy od 20 lat udział jachtu płynącego pod polską banderą w regatach TRANSAT. Joanna Pajkowska startowała na 40-stopowym jachcie Ntombifuti i za rejs otrzymała Honorową Nagrodę Polskiego Związku Żeglarskiego Rejs Roku 2000. Uczestniczka OSTAR 2013 oraz regat OSTAR 2017. W 2019 roku ukończyła jako pierwsza Polka samotny rejs non-stop dookoła świata.